Chez certaines personnes, on a constaté qu'un état de stress ou de fatigue peut encourager la venue d'aphtes. Mais les études scientifiques faites sur le lien entre le stress et les aphtes sont parfois contradictoires.
Une chose est sure : l'aphte lui-même peut entraîner un état de fatigue, d'anxiété et de stress, réduire la qualité du sommeil, avoir de graves conséquences sur la vie professionnelle de certaines personnes (journalistes, acteurs, musiciens à vent, …). Cet accroissement du stress n'est pas sain pour l'organisme et peut encourager la venue d'autres maladies13.
Les aphtes ont donc des conséquences directes (douleur, difficultés pour avaler, pour parler…) mais aussi potentiellement indirectes sur l'organisme.